Las bacterias de humanos y animales siguen mostrando resistencia a los antimicrobianos, como se ha podido observar en el último tiempo en diferentes partes del mundo, y un informe publicado por la Autoridad Europea de Seguridad Alimentaria (EFSA) y el Centro Europeo para la Prevención y Control de Enfermedades (ECDC) confirma esta situación. El informe destaca algunos problemas emergentes y confirma la resistencia a los antimicrobianos (AMR) como una de las mayores amenazas para la salud pública. AMR reduce la efectividad de las opciones de tratamiento.

Entre los nuevos hallazgos, basados en datos de 2016, están la detección de resistencia a carbapenémicos en la avicultura, un antibiótico que no está autorizado para su uso en animales, y de Salmonella Kentucky que produce BLEE con alta resistencia a ciprofloxacina en humanos, que se informó por primera vez en cuatro países.

• Una de cada cuatro infecciones por Salmonella en humanos es causada por la bacteria Salmonella que muestra resistencia a tres o más antimicrobianos de uso común en medicina humana y animal. La proporción es significativamente más alta en S. Kentucky y S. Infantis (76.3 y 39.4% respectivamente). 
• Por primera vez, se detectó S. Kentucky que produce BLEE (ESBL) con alta resistencia a la ciprofloxacina en cuatro países. Este tipo de bacteria no se puede tratar con antibióticos críticamente importantes.
• La bacteria Campylobacter, que causa la enfermedad transmitida por los alimentos más común en la UE, muestra una gran resistencia a los antibióticos ampliamente utilizados (resistencia al ciprofloxacino 54,6% en C. jejuni y 63,8% en C. coli, resistencia a tetraclinetas 42,8% en C. jejuni y 64,8 % en C. coli). Los niveles de resistencia aumentaron en dos de los tres antibióticos analizados (ciprofloxacina y tetraciclina), pero la resistencia combinada a los antimicrobianos de importancia crítica es estable y en general baja (0,6% en C. jejuni y 8,0% en C. coli). Sin embargo, en algunos países, al menos una de cada tres infecciones por C. coli era resistente a múltiples antibióticos importantes, dejando muy pocas opciones de tratamiento para las infecciones graves.

Animales y alimentos

• La resistencia a los antibióticos carbapenémicos se detectó a muy bajo nivel en la avicultura de postura y en la carne de pollo en dos Estados miembros (quince aislados bacterianos de E. coli). -Los carbapenémicos se usan para tratar infecciones graves en humanos y no están autorizados para su uso en animales.
• Se informó que dos aislados bacterianos de Staphylococcus aureus resistentes a la meticilina asociados a la ganadería, encontrados en porcinos eran resistentes a la linezolida. Linezolida es uno de los antimicrobianos de último recurso para el tratamiento de infecciones causadas por SARM altamente resistente.
• La resistencia clínica combinada a antimicrobianos de importancia crítica se observó en niveles bajos a muy bajos niveles bajos en Salmonella (0.2%), Campylobacter (1%) y E. coli (1%) en aves de corral.
• Se observó resistencia a la colistina a bajos niveles (2%) en Salmonella y E. coli en aves de corral.
• La prevalencia de E. coli productora de BLEE en aves de corral varía notablemente entre los Estados miembros, desde niveles bajos (menos del 10%) hasta niveles extremadamente altos (más del 70%). Las bacterias que producen enzimas ESBL muestran resistencia a múltiples fármacos a los antibióticos β-lactámicos, una clase de antibióticos de amplio espectro que incluye derivados de la penicilina, cefalosporinas y carbapenémicos. Esta es la primera vez que se monitorea la presencia de E. coli productora de Betalactamasa de Espectro Extendido (BLEE) en aves de postura comercial y carne de aves a muy bajos en Salmonella (0,2%), Campylobacter (1%) y E. coli (1%) en la avicultura.